Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms