Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms