Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms