Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms