Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4bQ9D8B3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4bQ9D8B3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms