Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nop56Q9D6Z1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nop56Q9D6Z1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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