Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ubxn11Q9D572 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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