Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms