Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms