Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms