Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MceeQ9D1I5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MceeQ9D1I5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms