Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1lQ9D1E5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms