Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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