Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms