Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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