Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms