Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms