Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms