Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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