Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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