Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms