Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms