Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr3Q99MB1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms