Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms