Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms