Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Ctu1Q99J10 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ctu1Q99J10 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ctu1Q99J10 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ctu1Q99J10 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ctu1Q99J10 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ctu1Q99J10 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ctu1Q99J10 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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