Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms