Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim7Q923T7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim7Q923T7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim7Q923T7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim7Q923T7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim7Q923T7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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