Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms