Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Slc6a20aQ8VDB9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Slc6a20aQ8VDB9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Slc6a20aQ8VDB9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Slc6a20aQ8VDB9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Slc6a20aQ8VDB9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Slc6a20aQ8VDB9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Slc6a20aQ8VDB9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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