Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms