Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms