Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nhlrc3Q8CCH2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nhlrc3Q8CCH2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nhlrc3Q8CCH2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nhlrc3Q8CCH2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nhlrc3Q8CCH2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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