Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms