Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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