Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ctdsp2Q8BX07 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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