Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp43Q8BUM9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp43Q8BUM9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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