Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms