Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hirip3Q8BLH7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hirip3Q8BLH7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms