Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4aQ8BIE6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms