Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg4dQ8BGV9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4dQ8BGV9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4dQ8BGV9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4dQ8BGV9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg4dQ8BGV9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4dQ8BGV9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4dQ8BGV9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4dQ8BGV9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4dQ8BGV9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg4dQ8BGV9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg4dQ8BGV9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg4dQ8BGV9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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