Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NanogQ80Z64 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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