Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ttc28Q80XJ3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ttc28Q80XJ3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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