Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms