Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sys1Q78S06 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Sys1Q78S06 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sys1Q78S06 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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