Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms