Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms