Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms