Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trak1Q6PD31 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms