Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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